Voorkomen is beter dan genezen. Daarom moet je er eerst voor zorgen dat je keuken proper is. Was al je fruit grondig uit onder stromend water voordat je het in de fruitmand legt. Bewaar groenten en fruit in een afgesloten bak of in de koelkast. Spoel al je flessen goed uit vooraleer je ze neerzet. Last but not least, let erop dat je de vuilnisbak goed afsluit.
Fruitvliegjes hebben net zoals veel insecten een hekel aan de sterke geur van kruiden. Snijd een sinaasappel doormidden en stop er wat kruidnagel in. Deze geur werkt afstotend. Leg er de volgende dag de andere helft van de sinaasappel over. Losse kruidnagels, lavendel, dille, salie of knoflook tussen het fruit helpen ook.
Heb je nog een beetje wijn over? Zet een fles met een bodem wijn in je keuken. De vliegjes zullen erin kruipen en kunnen er niet meer uitkomen waardoor ze verdrinken. Heb je toch het gevoel dat ze eruit vliegen? Zet de kurk erop en schud ermee. Geen wijn in huis? Het werkt ook met bier!
Azijn is een handig schoonmaakmiddel, maar is wat minder handig wanneer het om fruitvliegjes gaat. De kleine beestjes houden van azijn. Je kunt ze wél vangen door een schaaltje water te mengen met ecologisch azijn, voeg daarbij een scheutje afwasmiddel toe zodat ze door het water zakken.