Verwarm de oven voor op 180 °C en bekleed een muffinblik met 12 papieren vormpjes. Verwijder de schil en de pitten van de pompoen. Snijd het vruchtvlees in kleine blokjes. Kook de pompoenblokjes zacht in een pan met water. Giet af en pureer de pompoen tot een gladde massa. Laat de pompoenpuree volledig afkoelen. Zeef de bloem, het bakpoeder, de baking soda, het zout, de kaneel, de nootmuskaat, de gember en de kruidnagel in een grote kom. Roer goed door elkaar. Klop in een aparte kom de eieren los en voeg de suiker toe. Klop het mengsel licht en luchtig. Voeg de olie toe en klop verder. Voeg vervolgens de afgekoelde pompoenpuree en de melk toe en meng tot een glad beslag. Voeg de droge ingrediënten in delen toe aan het natte mengsel. Meng voorzichtig met een spatel. Vermijd overmixen om luchtige muffins te behouden. Verdeel het beslag gelijkmatig over de 12 muffinvormpjes in het muffinblik. Bak de muffins in de voorverwarmde oven gedurende 20 tot 25 min. Haal de muffins uit de oven en laat ze 5 min in de vorm afkoelen. Verplaats ze daarna naar een rooster om volledig af te koelen.